Ưu điểm lớn nhất của việc ứng dụng công nghệ vi sinh trong phòng trừ sâu bệnh là:

Làm cho sản phẩm nặng hơn.

Tăng giá trị sử dụng, kéo dài thời gian bảo quản và đa dạng hóa sản phẩm.

Loại bỏ hoàn toàn vitamin trong thực phẩm.

Giảm giá thành bán ra của sản phẩm thô.

Vi khuẩn gây hại.

Cỏ dại.

Sâu ăn lá, rầy, bọ cánh cứng.

Các loại virus.

Phun thuốc hóa học.

Bắt sâu bằng tay.

Sử dụng thiên địch (ong mắt đỏ).

Cày lật đất để diệt nhộng.

Tăng lượng giống cần thiết.

Giảm năng suất cây trồng.

Đảm bảo mật độ, độ sâu đồng đều và tiết kiệm công lao động.

Làm cho cây không bị sâu bệnh.

Tiêu diệt sâu tại ruộng.

Ngăn chặn sự lây lan của sâu bệnh nguy hiểm từ vùng này sang vùng khác, từ nước ngoài vào trong nước.

Tăng năng suất cây trồng.

Bón phân hợp lý.